微生物体系学研讨范畴取得重要开展

  近来，烟台大学生命科学学院微生物（微藻）立异使用团队在微生物体系学研讨范畴取得重要开展，研讨团队根据全基因组剖析初次清晰了中慢生根瘤菌属及其近源属的属级分类基因阈值，立异提出9个新属并完结15个物种的科学重分类，为微生物分类学供给了新的参阅规范。相关效果宣布在基因组及生物信息学范畴期刊《BMC基因组学》。

  根瘤菌是农业微生物中的重要类群，尤其在植物固氮进程中发挥着关键作用。但是，中慢生根瘤菌属与近源的多个属的分类联系一向较为紊乱，多个不同属的物种在进化树上稠浊在一起。因为现有的微生物分类体系缺少属级分类的规范，这一问题严峻阻止了该类群的体系学研讨和实践使用。

  为处理这一难题，研讨团队根据体系基因组学办法，构建了叶瘤杆菌科一切典型菌的全基因组体系发育树。研讨团队经过一系列剖析539个中心蛋白序列，将中慢生根瘤菌属及其近源的4个属划分为15个簇和亚簇。

  经过生物信息学软件，研讨团队从DNA和蛋白层面计算了一切典型菌间的差异度，发现典型菌间全基因组的均匀核苷酸共同度为77.40%至80.91%，中心蛋白均匀氨基酸共同度为83.98%至86.16%，这一些数据距离为属级分类供给了清晰的阈值。根据这些发现，研讨团队将全基因组体系发育树的15个（亚）簇分类为15个属，并提出了9个新属的树立，一起对15个种进行了重分类研讨。

  该研讨近来正式取得世界微生物体系委员会认可，研讨团队提出的9个新属已悉数列入原核微生物分类名录。

  论文榜首作者兼通讯作者、烟台大学生命科学学院副教授李岩介绍，这一效果不只为微生物分类学供给了新的参阅规范，也为相关菌株的使用研讨奠定了科学根底。该研讨为原核生物在属级分类单元的科学分类供给了新的研讨办法和根据，处理了长期以来困扰微生物分类学的难题，不只推动了微生物体系学的开展，也为农业微生物的使用研讨供给了重要的理论支撑。